除了基礎情緒科學研究與相關技術開發，實驗室也與臨床醫學合作（如精神醫學、神經內科、視網膜等），將所開發的技術，及研究所知延伸至臨床，嘗試輔助解決臨床問題。
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體顯性腦動脈血管病變合併皮質下腦梗塞及腦白質病變(CADASIL)之微出血偵測與好發區域探討
Cerebral autosomal dominant arteriopaty with subcortical infarcts and leukoencephalopathy (CADASIL)是一種遺傳性腦中風，由於NOTCH3變異而導致，因患者小血管特別脆弱，容易反覆的中風，或認知功能逐漸下降。目前臨床上是由醫師手動看每張影像一一圈選病灶，整理及分析上都不太容易，運用實驗室開發的「腦微出血自動分割模型」，發現大腦微出血 (cerebral microbleeds) 常見於丘腦(thalamus)，丘腦、顳葉、與額葉隨著疾病進展，大腦微出血的數量與體積也會變多變大。
Chih-Ping Chung+, Jiun-Wei Chen+, Feng-Chi Chang, Wei-Chi Li, Yi-Chung Lee, Li-Fen Chen*, and Yi-Chu Liao* (2020). Cerebral microbleed burdens in specific brain regions are associated with disease severity of CADASIL. Journal of the American Heart Association, e016233. -
利用多重影像與臨床資料輔助早期診斷老年憂鬱症患者共病巴金森氏症
精神醫學門診會遇到老年憂鬱症(major depression)合併巴金森氏症(Parkinson disease,PD)的患者。巴金森氏症是一種慢性的神經系統退化疾病，初期症狀不明顯，研究顯示巴金森氏症共病憂鬱症的比例高，本研究嘗試建立單光子SPECT 99mTc-Trodat 銀髮族群的常模，以及配合其他相關資訊，期望能找出輔助診斷之指標。
進行中。 -
利用基於光束成像之跨頻相位振幅耦合探討原發性痛經女性於經痛時對情緒聲調的處理歷程
運用我們所開發的分析技術，我們發現原發性痛經女性在經痛時對不同情緒聲調的內隱情緒處理歷程，在負向聲調處理腹側聽覺區與枕葉頂葉區有高度的theta-gamman 及 alpha-gamma頻帶的連結，顯示反覆喚起聽覺感覺記憶及注意力轉換，對於有更多疼痛經驗的痛經女性聽覺區與顳葉頂葉區域有高強度連結，這樣的發現支持了所開發的分析技術不僅在腦訊號源重建之可行性及應用性，也可應用至臨床議題探討。
Hui-Ling Chan+*, Intan Low+, Li-Fen Chen, Yong-Sheng Chen, Jen-Chuen Hsieh*. A novel beamformer-based imaging of phase-amplitude coupling (BIPAC) unveiling the inter-regional connectivity of emotional prosody processing in women with primary dysmenorrhea. Journal of Neural Engineering, 18:046074.